Les échantillons cliniques recommandés par l’OMS pour le diagnostic de la tuberculose pulmonaire chez les enfants et les adolescents à l’aide d’un test Xpert MTB/RIF ou Ultra comprennent les expectorations (simples ou induites), le liquide d’aspiration gastrique, le produit d’aspiration nasopharyngée et les selles. Les autres TDMRO réalisés sur des échantillons des voies respiratoires n’ont été validés que sur des échantillons d’expectorations. Chacun de ces différents types d’échantillons présente des avantages et des inconvénients spécifiques (Tableau 4.1).